不会。

1.江户时代是日本由封建体系向专制过渡的时代，幕府不会允许台湾这种规模的一个藩属存在。

2.东宁并非王国，而是明帝国藩属，在明帝国灭亡后具有流亡政府或者说小朝廷的性质，而明帝国是东亚朝贡体系的核心，其潜在的继承者不可能向之前的朝贡者称臣。

3.幕府若附庸郑氏政权，等同于与清帝国为敌，如同今日承认台湾的合法性即是与匪国为敌。而在17世纪，同属东亚的江户日本的国力根本不足以战胜清帝国。

清帝国对台湾的声索，实际上并不出于领土野心，而是出于政权合法性的恐惧。要保全台湾的独立，也有两个办法：

方法1.将当地汉人连带郑氏家族赶尽杀绝。

方法2.与葡萄牙联盟，并推翻郑氏家族。

按照历史的发展来看，方法2还是不错的。在葡国失去远东影响力后，直接转投不列颠，那么就没有香港什么事情了。这样的台湾会在二战时被日本进攻，战后随殖民地解放浪潮独立并加入英联邦，妥妥的发达国家。