此后，在陈炯明与孙文相持期间，彭湃又与陈炯明有过几次会面。陈炯明希望彭湃留下来，在其司令部当秘书。彭湃拒绝了，他发现陈东山再起的希望相当渺茫，而得到苏俄金钱和武力支持的孙文政权似乎才是中国未来的希望。

有一次，陈炯明在机要课室与彭湃等人谈论革命，陈说：“中国最大的军阀袁世凯，业已灭亡；其次是孙中山，哼！孙而不打倒，广东无安宁日子；现在孙中山居然主张共产，与列宁同一错误。列宁是抢私为公，现在中国最适合的是基尔特的主张。”

彭湃大胆反驳说：“在中国现在不要说什么主义，最要紧的是解放全国多数农工群众的痛苦。如能在实际上主张工农的利益，为中国大多数民众谋幸福，切实革命的，我们应认他是好的！”[17]两人之分岐已然无法调和。

在陈炯明与孙文最后一战前夕，农会其他领导劝说彭湃再去陈的司令部，以获得陈的谅解和支持。彭湃携带着行李到陈的总司令部。此时，街上警察军队大戒严，因陈要经过。彭湃等人到了总司令部，看见绅士、官僚、地主、资本家、买办，“面团团肚肿肿的一些怪物”，纷至沓来，为陈送行。彭湃看到此情形，“不知几多火起，恨不能把他一概用机关枪扫光！”[18]

由此，彭湃更以为同伴主张他到惠州的政策不对，是绝对无用的。此时，正好有劳工同志来，对彭说：“你去后，此间同志一个钱都没有，饭尚无可食，怎样活动呢？”这句话反倒更确定了彭的观念，乃取电纸拟一电以告陈，说：“湃的母亲病危在家，要即回家省亲。”陈看了电后召彭见面说：“我是从海丰汕尾经过的，你可同我一路。”彭说：“我尚有舍弟的家眷要我带回去的，所以我从陆路出发。”陈说：“也可以，你母亲病好当去惠州。”彭说：“是的。”

寥寥数语之后，彭湃与陈炯明从此分道扬镳，“这时我脱离了陈，精神都轻快起来！”[19]